در قانون جدید مالیات بر ارزش افزوده مهلت پرداخت مالیات و عوارض ، تا یک ماه پس از پایان هر دوره ( فصل ) مقرر شده است
مطابق ماده ۴ قانون یادشده مودی مکلف است حداکثر تا پایان ماه پس از انقضای هر دوره مالیاتی، کل مالیات و عوارض متعلقه را پس از کسر اعتبار مالیاتی خود، پرداخت نماید.
برابر ماده ۱۳ همین قانون، پس از راه اندازی سامانه مودیان ( موضوع قانون پایانه های فروشگاهی و سامانه مودیان ) همه ی مشمولان مقررات مالیات بر ارزش افزوده، موظفند به ترتیبی که مقرر می شود در سامانه مزبور ثبت نام و معاملات خود را در آن ثبت نمایند. ثبت معاملات ( خرید و فروش ) در سامانه به منزله ثبت در دفاتر قانونی است.
تا زمان راه اندازی سامانه مودیان ، ترتیبات ثبت نام، نحوه ارائه اظهارنامه های مالیاتی و رسیدگی به آنها حسب مقررات قانون مالیات بر ارزش افزوده سابق خواهد بود. در سایر موارد مفاد قانون جدید جاری خواهد بود.